Oprócz programów operacyjnych działających w skali całego kraju możemy również wyróżnić specjalistyczne projekty działające np.: w skali regionu, lub w ramach poszczególnych gałęzi produkcji np.: rybołówstwo. Dzięki temu władze centralne a także poszczególne samorządy mogą lepiej zorganizować środki pieniężne tam gdzie są one najbardziej niezbędne.

Regionalne Programy Operacyjne na lata 2007-2013 (RPO)

W ramach RPO możemy, więc wyróżnić 16 Regionalnych Programów Operacyjnych dla każdego województwa. Rozwiązanie to ma na celu identyfikowanie potrzeb na jak najniższym szczeblu, tak, aby działania zawarte w RPO odpowiadały planom rozwoju każdego województwa z osobna. Samorządy województw otrzymały szerokie kompetencje związane z przygotowaniem i realizacją RPO.

Podstawowe cele RPO:

• wzrost konkurencyjności regionów,
• promowanie trwałego i zrównoważonego rozwoju,
• podnoszenie spójności społeczno-gospodarczej
  i przestrzennej obszarów.

Cele szczegółowe:

• poprawa infrastruktury technicznej i społecznej regionu,
• poprawa stanu środowiska przyrodniczego, lepsze wykorzystanie jego zasobów i walorów w rozwoju społeczno-gospodarczym,
• budowa społeczeństwa informacyjnego,
• tworzenie warunków wzrostu konkurencyjności gospodarki,
• odnowa i ożywienie społeczno-gospodarcze miast
  i obszarów zdegradowanych.

Inwestycje, na które pozyskuje się środki z Regionalnego Programu Operacyjnego, powinny zostać zrealizowane na terenie danego województwa. Priorytety w poszczególnych Regionalnych Programach Operacyjnych są do siebie zbliżone.

Obszary priorytetowe RPO:

• badania i rozwój technologiczny (BRT), innowacje i przedsiębiorczość,
• społeczeństwo informacyjne,
• transport,
• energia,
• ochrona środowiska i zapobieganie zagrożeniom,
• turystyka,
• ochrona dziedzictwa kulturowego,
• rewitalizacja obszarów miejskich i wiejskich,
• infrastruktura edukacyjna,
• infrastruktura ochrony zdrowia oraz infrastruktura społeczna,
• inicjatywy lokalne w zakresie zatrudnienia i rozwoju oraz wsparcie dla struktur świadczących usługi lokalne w tworzeniu nowych miejsc pracy.

Kluczową rolę w zarządzaniu i wdrażaniu RPO pełnią:

Instytucja Koordynująca - Departament Koordynacji Programów Regionalnych w MRR – jego celem jest zapewnienie zgodności RPO i ich realizacji z celami Narodowej Strategii Rozwoju, negocjowanie programów z Komisją Europejską we współpracy z instytucjami zarządzającymi RPO.

Instytucja Zarządzająca – Zarządy Województw, które odpowiadają za zarządzanie programem operacyjnym i jego realizację zgodnie z zasadą należytego zarządzania finansami oraz za przestrzeganie standardów ustalonych przez MRR.